Институт фундаментальной медицины и здоровьесбережения создан решением Ученого совета университета от 28 февраля 2023 года и приказом ректора т 01 марта 2023 года.

В его состав вошли кафедры «Фундаментальной медицины, здравоохранения и здоровьесбережения» и «Физическое воспитание и спорт».

В СевГУ проводятся подготовительные мероприятия по созданию университетской клиники, анатомического корпуса, производится закупка необходимого оборудования и материалов для реализации учебного процесса.

Дирекция и медицинские кафедры расположены по адресу ул. Курчатова, 7. Кафедра «Физическое воспитание и спорт» базируется по адресу ул. Университетская, 28.

Институт фундаментальной медицины и здоровьесбережения создан с целью консолидации компетенций по подготовке кадров для медицинской отрасли, в первую очередь для нужд здравоохранения Севастополя. Еще одна цель структурного подразделения — развитие медицинских научных направлений университета из числа имеющихся компетенций: биофизики, жидкостного дыхания, искусственного интеллекта, а также новых направлений — медицинской реабилитации и фармакотерапии.