Научные направления в Азовском морском институте определяются исходя из уровня квалификации сотрудников, их творческих интересов и направленности в образовании. Во взаимодействии с ведущими ученными Севастопольского государственного университета профессорско-преподавательский состав АМИ определяет актуальность научных изысканий и занят подготовкой к проведению исследований и теоретических разработок.

В настоящее время основными направлениями научной деятельности являются:

1. Исследования проблем эксплуатации флота в акватории Азовского моря.

2. Разработка методов оптимизации внутрицилиндровых процессов в судовых двигателях внутреннего сгорания, (с учетом практических наблюдений эксплуатации).

3. Логистика морского флота как единая система, обеспечивающая жизнедеятельность Донецкой Народной республики в экономическом пространстве России.

Отмеченные направления основываются на результатах исследований и публикаций, авторами которых являются сотрудники института (в целом опубликовано более 30 работ).

Научный потенциал института формируется из доцентов, кандидатов технических наук, профессора и специалистов-практиков, имеющих большой опыт работы на флоте – капитанов дальнего плавания и старших механиков. Благодаря такому сочетанию в составе контингента сотрудников удается обнаруживать наиболее существенные решения при разработке научных проблем.

Научная работа основывается на возможном использовании имеющейся материально-технической базы института (лаборатория двигателей внутреннего сгорания, современные тренажеры, позволяющие имитировать выдвигаемые инновации в эксплуатационных условиях, лаборатория электронной микроскопии). В перспективе эта база будет совершенствоваться, что позволит вывести научно-практические исследования на новую орбиту.

Учитывая становление института как филиала, а также его перспективы, крайне важным является подготовка молодых научных кадров, что требует вовлечение в процессы научных разработок молодых и перспективных исследователей. В этом отношении появилась возможность в реализации таких планов за счет потенциала университета и создания мотивированных условий для обучения в аспирантуре СевГУ.